造成腹痛的病因有太多，下列依据患病部位列举部分常见的病因。

消化道：胃肠炎、食物中毒、阑尾炎、炎症性肠病（溃疡性结肠炎和克罗恩病）、肠易激综合征、消化性溃疡、胃肠道穿孔、胆囊炎、胆结石、胰腺炎、肝炎、肝脓肿、肝癌等。

泌尿生殖系统：肾盂肾炎、膀光感染、泌尿系结石梗塞。

腹部血管有关：缺血性肠病、主动脉夹层。

女性生殖系统：卵巢囊肿、宫外孕。

胸部病症所导致的的牵涉痛：如心肌梗塞、心梗、肺炎、肺梗死等。

器质性病变：腹型过敏性紫癜、糖尿病、铅中毒、血卟啉病。

在造成腹痛的原因中，可以说消化道疾病占据着很大的部分。